Der Permatop-Verein vergibt an jene Mitglieder Permapunkte als Belohnung, die sich bei Projekten im Verein, durch regelmäßige Mithilfe in den Permatopgärten, auf der Webseite oder in der Vereinsorganisation besonders engagieren, oder neue Fertigkeiten erlernt haben und an Veranstaltungen des Vereins teilgenommen haben.
Permapunkte ermöglichen eine Beteiligung an der Ernte aus den Vereinsgärten. Permapunkte sollten auch zum Tausch von Permatop-Erzeugnissen eingesetzt werden können bzw. auch zum Tausch gegen Tauschgutscheine regionaler Tauschkreise.